La bioinformatique est un domaine interdisciplinaire qui combine la biologie, l'informatique et les mathématiques pour analyser et interpréter les données biologiques. Voici un aperçu des principaux sujets et concepts que l'on retrouve dans un cours sur la bioinformatique :
1. Introduction à la bioinformatique
- Définition et importance de la bioinformatique.
- Applications principales :
- Analyse des séquences d'ADN, ARN et protéines.
- Annotation génomique.
- Modélisation des structures biologiques.
- Études évolutives et phylogénie.
- Analyse des données d'expression génétique (RNA-seq, microarrays).
- Bioinformatique médicale (ex. : identification des mutations associées aux maladies).
2. Bases biologiques
- Structure et fonction des macromolécules biologiques :
- ADN, ARN, protéines.
- Génomique : séquences génétiques et organisation des génomes.
- Protéomique : structure et fonction des protéines.
- Concepts clés en biologie moléculaire (ex. : transcription, traduction, épissage).
- Notions de biologie évolutive (phylogénie, mutations, alignements).
3. Outils informatiques
- Introduction aux bases de données biologiques :
- NCBI, EMBL, UniProt, Ensembl.
- Logiciels et outils courants :
- BLAST (Basic Local Alignment Search Tool).
- Clustal Omega (alignement multiple de séquences).
- MEGA (phylogénie).
- PyMOL (visualisation des structures).
- Enseignant: Kaddar Bachir