الفهارس: الهدف من الفهارس هو تيسير الإفادة من الكتاب، وتختلف الفهارس بحسب الكتب، والفهارس التقليدية هي: فهرس الأعلام، وفهرس الأماكن والبلدان، وفهرس الكتب الواردة في النَّص، والفهارس  نوعان: فهارس بسيطة، وفهارس مُفصَّلة.

  1. فهرس المحتويات: يعرض العناوين الرئيسية والفرعية التي يشملها المخطوط  ويقوم بمناقشتها بين صفحاته.
  2. فهرس المؤلفين والتراجم: يتضمن أسماء المؤلفين والتراجم التي تم استخدامها في المخطوط.
  3. فهرس الأحاديث وآيات القرآن الكريم: يورد الأحاديث النبوية والآيات القرآنية كما وردت في الكتاب.
  4. فهرس الاختصارات: يفسر المعاني المرادة من الاختصارات المستخدمة في المخطوط.
  5. فهرس الجداول والصور: يفسر أسماء الجداول والصور الموجودة في محتوى المخطوط